Die Mitglieder des Instituts wie auch Aus- und Weiterbildungsteilnehmer*innen am Alexander-Mitscherlich-Institut verpflichten sich auf ethisch begründetes Handeln und orientieren sich dabei an den Ethik-Leitlinien der Fachgesellschaften  Deutschen Psychoanalytischen Vereinigung (DPV) und Deutschen Gesellschaft für Psychoanalyse, Psychotherapie, Psychosomatik und Tiefenpsychologie  (DGPT) sowie an den Berufsordnungen der zuständigen Kammern, Psychotherapeutenkammer Hessen und Landesärztekammer Hessen.

Bei Fragen oder Konflikten zu ethischen Problemen können die Mitglieder und  Aus- und Weiterbildungsteilnehmer*innen des AMI sowie deren Patient*innen die Vertrauensleute des AMI konsultieren: Elisabeth Bulwien, Gerd Wittenberger.